BluePippin系統(tǒng)包括一次性的5泳道預(yù)制膠電泳槽,運行中,軟件通過實時光路檢測,和參考泳道中的 DNA ladder進(jìn)行比對,確定已經(jīng)設(shè)置回收長度范圍的自動化DNA段回收系統(tǒng)
DNA段到達(dá)洗提泳道(elution channel)的準(zhǔn)確時間。通過電極切換,打開洗提泳道,使目標(biāo)片段進(jìn)入洗提通道的回收室中,從而實現(xiàn)回收。然后電極再次切換,自動化DNA段回收系統(tǒng)
洗提泳道關(guān)閉,剩余的DNA分子進(jìn)入原先的分離泳道(separation channel)。
系統(tǒng)參數(shù):
1.自動化:軟件中設(shè)置回收片段起始bp和結(jié)束 bp,區(qū)間片段自動回收到回收室中
2.回收精度:片段大小回收范圍cv值可控制在8%以內(nèi)
3.重復(fù)性:≥90%
4.回收通量:一次實驗可以同時回收24個DNA樣品的大小片段
5.回收范圍(小片段):90-2000bp
6.回收范圍(長片段):6-50kb
7.回收率:50-80%
8.回收速度:30-40分鐘回收500bp片段
9.防小片段污染:能非常高效去除引物二聚體、接頭二聚體等各種小分子片段,大大提高測序?qū)嶒炐?/p>
10.大上樣量:1.5ugDNA
11.小上樣量:可對低至ng級的基因組DNA、ChIP-DNA(染色質(zhì)免疫共沉淀的基因組DNA)進(jìn)行回收
12.電壓:100V,或者脈沖場100V
13.光檢測:470nm 激發(fā),525nm發(fā)射
14.測序平臺:支持Illumine、Lifetech、Roche、Pacbio等主流二代、三代測序儀
15.應(yīng)用:三代測序Pacicbio High-pass文庫回收、二代測序常規(guī)的Paired-end文庫、RNA-seq文庫、miRNA-seq文庫、ChIP-seq文庫、外顯子組測序文庫、Nestera文庫、
PGM文庫、Proton文庫、RAD-seq文庫、甲基化測序文庫、目標(biāo)捕獲測序(Target-seq)轉(zhuǎn)基因測序文庫、臨床樣本測序文庫、病原微生物測序文庫等。