性能指標(biāo)
- 測(cè)序讀長(zhǎng)：平均讀長(zhǎng) 3-12 Kb，最長(zhǎng)可達(dá)30Kb；
- 一致性準(zhǔn)確率：一致性準(zhǔn)確率可達(dá) 99.99%；
- GC含量檢測(cè)能力：無(wú)需PCR擴(kuò)增，適合GC含量基因組；
- 堿基修飾：可直接讀取，并可以檢測(cè)未知堿基修飾及DNA損傷類型；
- 有效數(shù)據(jù)產(chǎn)量/Cell：0.5-1.2G/Cell；
- 輸出數(shù)據(jù)格式和數(shù)據(jù)兼容性：數(shù)據(jù)格式和二代兼容；
- 軟件：smrt analysis提供二級(jí)數(shù)據(jù)分析
主要應(yīng)用
- 應(yīng)用于NGS文庫(kù)構(gòu)建、核酸提取、濃度均一化、PCR/qPCR/ddPCR體系構(gòu)建、Pooling、Hit Picking、質(zhì)譜樣品前處理、微生物培養(yǎng)等液體操作實(shí)驗(yàn)。
- 為生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、免疫學(xué)、化學(xué)、農(nóng)學(xué)、環(huán)境科學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)等研究領(lǐng)域提供專業(yè)的技術(shù)支撐服務(wù)。
樣品要求
- 來(lái)樣須知： 動(dòng)植物組織>2g； 排泄物：液體類（膽汁等）>600ul；糞便>1.5g； 唾液>5ml; 血液（抗凝）>1ml； 水樣類液體樣本>500ml，或提供提供過(guò)濾相應(yīng)體積水的濾膜（如微生物含量少，需增加送樣量）； 土壤類>1.5g; 基因組DNA總量>1.5ng，濃度>10ng/ul； PCR產(chǎn)物總量>10ng； 總RNA>4ug，濃度>80ng/ul； DNA文庫(kù)類：濃度>4nM，體積>20ul（需提供建庫(kù)方式說(shuō)明）； 未曾反復(fù)凍融； 未曾暴露在高溫環(huán)境（>65°C）和PH環(huán)境（< 6或> 9）； 未經(jīng)熒光染色或紫外照射（避免EB染色）； 不包含變性劑（如guanidinium salts 或 phenol）和洗滌劑（如SDS或Triton-X100）； 不包含不溶解的物質(zhì)； 不包含來(lái)自原始樣本的污染物（如heme, humic acid, polypheno等)； DNA樣本中不包含蛋白、RNA、糖類等污染； OD260/OD280 范圍在1.8 - 2.0（DNA），2.0-2.2（RNA）； OD260/OD230 約為2.0； 抗凝劑：可用或EDTA，不建議用肝素； 損傷較嚴(yán)重樣品需提前說(shuō)明，并與儀器操作人員聯(lián)系；病毒、致病微生物等危險(xiǎn)性樣本恕不接收。
儀器說(shuō)明
- Biomek i7自動(dòng)化工作站，其是一款中高通量的實(shí)驗(yàn)設(shè)備，具有多功能的工作空間、靈活的實(shí)驗(yàn)管理流程和簡(jiǎn)單的操作系統(tǒng)等特點(diǎn)。
- 可以實(shí)現(xiàn)全自動(dòng)化完成實(shí)驗(yàn)流程，能夠提高實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性，增加無(wú)人值守時(shí)間。
