CD46為一單鏈跨膜糖蛋白，其染色體定位于人類1號染色體短臂的32號區(qū)，分子量為45-70kDa，又命名為gp45-70，屬于補體活化調(diào)節(jié)蛋白因子家族。CD46的N端由四個補體控制蛋白（CCP）組成，后面是通過選擇性剪接產(chǎn)生的O-高度糖基化區(qū)域，并包含B和/或C異構(gòu)體。B和C結(jié)構(gòu)域富含氨基酸絲氨酸、蘇氨酸和脯氨酸（STP），并通過功能未知的12個氨基酸區(qū)域與跨膜結(jié)構(gòu)域相連。
CD46的細胞內(nèi)區(qū)域由兩種氨基數(shù)目不同的短尾(Cyt1包含16個氨基，cyt2含有23個氨基)組成。選擇性剪接可產(chǎn)生帶有CYT-1的同工型或帶有CYT-2的同工型，它們都含有信號傳導(dǎo)基序，并且在炎癥環(huán)境中差異表達
人CD46也稱為膜輔因子蛋白（MCP），屬于補體激活調(diào)節(jié)劑（RCA）蛋白質(zhì)家族。除了CD46，RCA家族還包括衰變加速因子（CD55 / DAF）、補體受體1（CR1 / CD35）和2（CR2 / CD21）、C4結(jié)合蛋白和H因子（FH）。如Figure2所示，CD46作為膜輔因子介導(dǎo)的C3b和C4b裂解輔助因子，是先天免疫系統(tǒng)中經(jīng)典和選擇性補體激活級聯(lián)反應(yīng)的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子[6]。裂解多余的C3b可以產(chǎn)生膜結(jié)合的C3bi和可溶性C3f。C4b的裂解可以產(chǎn)生膜結(jié)合C4d和可溶性C4c。