土壤呼吸是指土壤中的植物根系、食碎屑動物、真菌和細菌等進行新陳代謝活動.消耗有機物，產(chǎn)生二氧化碳的過程。土壤呼吸的嚴格意義是指未擾動土壤中產(chǎn)生二氧化碳的所有代謝作用。土壤呼吸可分為自養(yǎng)呼吸和異養(yǎng)呼吸，前者指根呼吸和根際微生物呼吸，后者指土壤微生物和動物呼吸。
土壤呼吸簡單的說就是指土壤釋放二氧化碳的過程，和人的呼吸一樣。土壤中的微生物的呼吸、作物根系的呼吸和土壤動物的呼吸都會釋放出大量的二氧化碳。土壤呼吸是表征土壤質量和土壤肥力的重要指標，也可以反應生態(tài)系統(tǒng)受到環(huán)境變化的影響。當然，土壤呼吸還為植物提供光合原料二氧化碳。
土壤呼吸是土壤生態(tài)系統(tǒng)碳素循環(huán)的一個重要過程，是土壤碳素同化異化平衡作用的結果，也是碳素由陸地生態(tài)系統(tǒng)返回大氣的主要途徑，是土壤中生命活動的表征，準確測定其釋放量是評價生態(tài)系統(tǒng)中生物學過程的關鍵；通過對土壤呼吸及其相關參數(shù)的監(jiān)測，可估測根系和土壤微生物對氣候變化的響應。
土壤呼吸測量系統(tǒng)，可以同時顯示呼吸室內部的CO2濃度、溫度和濕度變化以及外部光合有效輻射強度。廣泛應用于農(nóng)業(yè)生態(tài)科研、碳源碳匯研究、全球氣候變化、土地利用方式改變、生態(tài)修復研究、土壤微生物活力評估、植物生態(tài)研究、昆蟲呼吸、根系呼吸以及水果貯藏。
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