蛋白質(zhì)免疫印跡雜交實(shí)驗(yàn)(Western Blotting)是成熟 mRNA 翻譯指導(dǎo)蛋白質(zhì)合成量分析檢測手段中zui經(jīng)典和zui廣泛為業(yè)界認(rèn)可的一種,也是論文中zui常見的數(shù)據(jù)呈現(xiàn)形式之一。雖然Western Blot實(shí)驗(yàn)原理比較簡單,但是實(shí)驗(yàn)耗時長、步驟繁瑣和實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)性差,導(dǎo)致剛進(jìn)實(shí)驗(yàn)室的小伙伴們,實(shí)驗(yàn)做的焦頭爛額。
那么如何做出一手漂亮的Western Blot實(shí)驗(yàn)結(jié)果呢,請小伙伴們跟隨恒遠(yuǎn)的腳步,了解Western Blot實(shí)驗(yàn)的相關(guān)知識,let's go!
Western Blotting實(shí)驗(yàn)原理:
蛋白質(zhì)印跡法(免疫印跡試驗(yàn))即Western Blot,簡稱WB。其基本原理是通過特異性抗體對凝膠電泳處理過的細(xì)胞或生物組織樣品進(jìn)行著色,將電泳分離后的細(xì)胞或組織總蛋白質(zhì)從凝膠轉(zhuǎn)移到固相支持物(NC膜或PVDF膜)上,然后用特異性抗體檢測某特定抗原的一種蛋白質(zhì)檢測技術(shù)。
Western Blotting實(shí)驗(yàn)步驟:
1.樣品制備
2.電泳分離
3.轉(zhuǎn)膜
4.封閉
5.抗體孵育
6.清洗
7.檢測
樣品制備
樣本制備是決定蛋白質(zhì)免疫印跡是否成功的關(guān)鍵步驟之一。樣本必須進(jìn)行研磨、勻漿、超聲處理。膜蛋白需用更劇烈的方法抽提,低豐度膜蛋白可能還要分步抽提(超速離心)。還需要注意的一點(diǎn)就是組織中的蛋白酶活性更強(qiáng),需要加入PMSF抑制酶的活性。思科捷為大家提供強(qiáng)、中、弱三種RIPA裂解液,以及適用于各種類型的蛋白酶抑制劑。
電泳分離
準(zhǔn)備好樣品后,第二步就是上樣和電泳分離了,上樣之前小伙伴們要做的必要步驟是確定蛋白質(zhì)濃度,根據(jù)蛋白質(zhì)濃度確定上樣量。星博士給大家推薦BCA和Bradford兩款蛋白濃度測定試劑盒,小伙伴們可以根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)需求自行選擇。
測完了蛋白質(zhì)濃度,接下來就是上樣了。首先要制備凝膠,選用SDS-PAGE凝膠配制試劑盒(EC0003),簡單省時。然后安裝電泳槽,將膠片安置在電泳槽中,在電泳裝置中加入SDS-PAGE電泳液。思科捷提供10×的電泳液,稀釋后直接使用,方便快捷。
上樣結(jié)束后,設(shè)置電泳程序一般濃縮膠80V,分離膠120V,電泳時間一般為1-2小時,根據(jù)溴酚藍(lán)指示位置選擇停止電泳時間即可。
轉(zhuǎn)膜
針對特定分子量大小靶蛋白而選擇適當(dāng)轉(zhuǎn)膜條件(轉(zhuǎn)膜時間,轉(zhuǎn)膜緩沖液和必要低溫環(huán)境)能夠?qū)?SDS-PAGE 膠上蛋白樣品盡可能*轉(zhuǎn)移到印跡膜上,同時減少蛋白不必要的降解,這對于終獲得清晰、可信結(jié)果也是需要考慮因素。轉(zhuǎn)膜方式主要包括濕式電印跡法(*轉(zhuǎn)膜方法)、半干式電印跡(可選的替代轉(zhuǎn)膜方法)以及干式電印跡(有限靈敏度的轉(zhuǎn)膜方法)。根據(jù)實(shí)驗(yàn)室習(xí)慣和需求,小伙伴們可以自行選擇轉(zhuǎn)膜方式。
膜的選擇
膜的選擇主要從實(shí)驗(yàn)?zāi)康暮蛯?shí)驗(yàn)要求來考慮,例如做分子量小于20kDa的小蛋白,0.45um的膜是不可取的,因?yàn)榭赡軙沟玫鞍滓蛲高^膜孔而造成膜結(jié)合的目的蛋白含量不確定,從而影響終結(jié)果的可靠性。通常小于20KDa的蛋白選擇0.2um的膜,而大于20KDa的蛋白選擇0.45um的膜。
靈敏度和分辨率:NC膜高,PVDF膜高
背景:NC膜低,PVDF膜較高
結(jié)合能力:NC膜80-110ug/cm2,PVDF膜125-200ug/cm2
材料質(zhì)地:NC膜干的NC膜易脆,PVDF膜機(jī)械強(qiáng)度高
溶劑耐受性:NC膜無,PVDF膜有
操作程序:NC膜緩沖液潤濕,避免氣泡,PVDF膜使用前甲醇潤濕
檢測方式:NC膜ECL檢測,PVDF膜ECL檢測
價格:NC膜較便宜,PVDF膜較貴
轉(zhuǎn)膜方式的選擇
濕轉(zhuǎn):
通常我們在做濕轉(zhuǎn)的時候,選擇100V恒壓(高強(qiáng)度,因?yàn)榈蛷?qiáng)度時間較長,且效率較低),電流控制在120-350mA之間,分子量在60KD以下的60分鐘即可,分子量在60KD以上的需要延長轉(zhuǎn)膜時間60-150分鐘才能確保率的轉(zhuǎn)膜。所以如果你所研究的兩個蛋白分子量差異比較大(如GAPDH 37KD,Ki67 358KD),你可以考慮將膠從中間分開,兩部分分別采用不同時間轉(zhuǎn)印,能達(dá)到你理想的效果。電轉(zhuǎn)液一般可以重復(fù)使用3次,之后電流會過大,不適合再使用。
濕轉(zhuǎn)優(yōu)點(diǎn):1.轉(zhuǎn)膜條件靈活容易進(jìn)行調(diào)整
2.多種Buffer可用于優(yōu)化轉(zhuǎn)印
3.可以延長轉(zhuǎn)印時間
4.可用于定量Western Blot
濕轉(zhuǎn)缺點(diǎn):1.Buffer加熱可能干擾轉(zhuǎn)印
2.在轉(zhuǎn)印的時候需要制冷裝置
3.需要大量的轉(zhuǎn)膜緩沖液
半干轉(zhuǎn):
對于半干轉(zhuǎn)來說,也需要進(jìn)行堆疊組裝(濾紙,膠,膜需要放在轉(zhuǎn)印buffer中進(jìn)行預(yù)平衡)放在裝置電極板的底部,蓋上上極板,高強(qiáng)的電流通過三明治結(jié)構(gòu),轉(zhuǎn)印速度較快,一般小于1h。
半干轉(zhuǎn)優(yōu)點(diǎn):1.轉(zhuǎn)膜速度快
2.用不連續(xù)的Buffer系統(tǒng)優(yōu)化轉(zhuǎn)印的蛋白
3.轉(zhuǎn)膜緩沖液用量少
4.容易安裝
5.對于同一蛋白的多張膜的分析比較有益
半干轉(zhuǎn)缺點(diǎn):1.低分子量蛋白容易轉(zhuǎn)過
2.對于分子量>120KDa的蛋白,轉(zhuǎn)印較困難
3.轉(zhuǎn)膜過程容易干膠
4.對于定量的Western實(shí)驗(yàn)不推薦使用
需要注意的是:低溫對于膜的轉(zhuǎn)印是至關(guān)重要的,尤其是在轉(zhuǎn)印時間較長而無人監(jiān)管的情況下。針對剛建的實(shí)驗(yàn)室平臺或者一些新蛋白的研究,經(jīng)過轉(zhuǎn)印的膠和膜都要通過染色確定轉(zhuǎn)膜效率(膠用考馬斯亮藍(lán)加熱染色,膜用麗春紅染色,均只需幾分鐘,并不耽誤太多時間),不然后面的實(shí)驗(yàn)既費(fèi)時也費(fèi)抗體。
封閉
在做Western blot實(shí)驗(yàn)中,因固相載體(如NC膜,PVDF膜)表面有很多孔,通過電轉(zhuǎn),膠上的蛋白被轉(zhuǎn)移到膜上,蛋白以機(jī)械填補(bǔ)(堆積)和吸附的方式結(jié)合于表面。蛋白塞進(jìn)了表面孔里面,但是蛋白并不是連續(xù)的,而有很多空隙,抗體也是蛋白,也會被吸附在空的洞里,這樣就會有很多非特異性的信號。
因?yàn)橛?ldquo;填補(bǔ)”和“覆蓋”蛋白結(jié)合位點(diǎn)以避免一抗的非特異性結(jié)合,所以有“封閉”的說法。星博士在此介紹常見封閉液的一些特點(diǎn),有助于大家選擇:
常見的封閉液——BSA
BSA是常用的封閉液,成分單一適用于大多數(shù)情況。若免疫原是偶聯(lián)BSA的,BSA有很強(qiáng)的免疫原性,會導(dǎo)致產(chǎn)生很多針對BSA的抗體,為避免交叉反應(yīng),不能用BSA,脫脂奶粉封閉,可以選用酪蛋白或無蛋白的封閉液。
常見的封閉液——脫脂奶粉
脫脂奶粉大的優(yōu)點(diǎn)是價格便宜,但由于成分相對復(fù)雜,所以適用范圍要狹窄一些。針對磷酸化蛋白的檢測不能用脫脂奶粉,脫脂奶粉含有酪蛋白,該蛋白本身就是一種磷酸化蛋白,使用會造成高背景磷酸化抗體也許會導(dǎo)致背景增加,此外,因?yàn)樽陨砗猩锼兀荒苡糜谏锼貥?biāo)記的抗體系統(tǒng)。
封閉體系并不是一成不變的,不同的封閉體系往往會得到不一樣的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,由此可見,做Western Blot實(shí)驗(yàn)中,封閉液的選擇也是需要謹(jǐn)慎的。
抗體孵育
一抗一般按照說明書進(jìn)行稀釋后,室溫孵育1-2h,或者4℃過夜。為了讓抗體充分與蛋白結(jié)合,大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室一般會選擇4℃過夜。一抗孵育結(jié)束后TBST洗滌三次,用稀釋后的二抗,室溫孵育1-3小時,TBST洗滌三次。
抗體是決定Western Blot實(shí)驗(yàn)成敗的關(guān)鍵因素,選擇具有一定文獻(xiàn)引用數(shù)的品牌不僅更容易得到清晰可信的結(jié)果同時更能夠得到同行認(rèn)可,針對一些表達(dá)峰度高且穩(wěn)定的蛋白可以選擇國產(chǎn)化抗體,既能保證實(shí)驗(yàn)結(jié)果準(zhǔn)確性又可降低實(shí)驗(yàn)成本,抗體的保存往往也是大家容易忽略的一個環(huán)節(jié),而因抗體保存不當(dāng)造成實(shí)驗(yàn)失敗的例子比比皆是。
保存溫度和條件(僅供參考)
對于很多抗體而言,分裝成小等份并凍存于-20℃或-80℃是*保存條件。分裝成小等份可zui大程度減少由凍融造成的抗體效價降低,以及從單個試劑瓶中多次吸取而引入的污染。小等份只需凍融一次,如有剩余,可將剩余物保存于4℃,建議一周內(nèi)用完。在收到抗體時,在10000×g下離心20秒以沉積截留于試劑瓶螺紋的溶液,并以小等份轉(zhuǎn)移至低蛋白結(jié)合微量離心管中。小等份的量取決于實(shí)驗(yàn)人員在實(shí)驗(yàn)中通常采用的量。小等份應(yīng)不小于10μl;等份越小,儲液濃度因抗體蒸發(fā)及吸附于保存瓶表面而受到的影響越大。
在大多數(shù)情況下,收到抗體時在4℃下保存一至兩周,然后再冷凍進(jìn)行長期保存是可以接受的,但也許腹水液是例外,它可能包含蛋白酶,因而應(yīng)該盡快凍存。不同品牌的抗體保存方式往往不同,具體保存方式需參考產(chǎn)品說明書。
檢測
抗體孵育完,就到了Western Blot實(shí)驗(yàn)的后一步——檢測了。
目前常用的檢測方法是ECL化學(xué)發(fā)光法,主要針對HRP標(biāo)記的二抗。思科捷為大家提供極超敏和超敏兩種ECL發(fā)光液供大家選擇。一款合適的發(fā)光液能使你的Western Blot圖片更加美觀。
Western Blot的基礎(chǔ)部分就先講到這里,歡迎小伙伴們在評論區(qū)留言,針對Western Blot實(shí)驗(yàn)的問題,恒遠(yuǎn)將一一為大家解答。
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