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當(dāng)前位置:上海莼試生物技術(shù)有限公司>>技術(shù)文章>>猴B皰疹病毒熒光定量 PCR 檢測(cè)試劑盒使用方法解析
一、樣品 DNA 的制備
1.用自選方法純化樣品的 DNA,本試劑盒跟市場(chǎng)上大多數(shù)病毒 DNA 提取試劑盒兼容。也可以選購(gòu)本公司的柱式病毒 DNAout。
二、引物的制備(在樣品制備室進(jìn)行)
2.按引物標(biāo)簽提示在裝引物干粉的管中直接加入適量的超純水(加入量見(jiàn)引物試管上的標(biāo)簽),使得兩條引物的濃度均為 10 μM(10 pmol/μL),然后各取 50 μL混合在一起,標(biāo)注為引物混合物,放冰上待用。
三、稀釋陽(yáng)性對(duì)照(以 10E2-10E7 這 6 個(gè) 10 倍稀釋度為例。由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,
因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行,千萬(wàn)不能污染樣品或本試劑盒的其他成
分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原,本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽(yáng)性對(duì)照,
猴B皰疹病毒熒光定量 PCR 檢測(cè)試劑盒(染料法)
Herpesvirus simiae qPCR Kit(Dye based) CAT#:11-180703
只提供可以直接使用的長(zhǎng)為 124bp 的 DNA 段作為陽(yáng)性對(duì)照。3. 標(biāo)記 6 個(gè)離心管,分別為 7,6,5,4,3,2。
4.用帶芯槍頭分別加入 45 μL 超純水(用帶芯槍頭,下同)。
5.先將本試劑盒提供的陽(yáng)性對(duì)照用超純水 10 倍梯度稀釋到 10E8 拷貝/μL。放冰上待用。
6.在 7 號(hào)管中加入 5 μL 10E8 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 10E7 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照。放冰上待用。
7.換槍頭,在 6 號(hào)管中加入 5 μL 10E7 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 10E6 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照。放冰上待用。
8.換槍頭,從 6 號(hào)管中取 5 μL 溶液到 5 號(hào)管中,充分震蕩 1 分鐘,得 10E5 拷貝/ μL 的陽(yáng)性對(duì)照。放冰上待用。
9.換槍頭,從 5 號(hào)管中取 5 μL 溶液到 4 號(hào)管中,得 10E4 拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照。放冰上待用。重復(fù)上面的操作直到得到 6 個(gè)稀釋度的陽(yáng)性對(duì)照。放冰上待用。
三、設(shè)置 PCR 反應(yīng)(20 μL 體系,在樣品制備室進(jìn)行)
10.在 PCR 管中加入下列成分(待測(cè)樣品需要做三次重復(fù),下表只列出一次。樣品管和陰性對(duì)照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽(yáng)性對(duì)照,并且陽(yáng)性對(duì)照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲(chǔ)存好后后加):
成分 樣品 陰性對(duì)照 陽(yáng)性對(duì)照(2-7 管)
2×qPCR Mix 10 μL 10 μL 各 10 μL
引物混合物 2 μL 2 μL 各 2 μL自備 10×ROX (見(jiàn)注) 2 μL 2 μL 各 2 μL
待測(cè)樣品 DNA 模板 1-5 μL 不加 不加
各 5μL(2 號(hào)樣到陽(yáng)性對(duì)照(2-7 號(hào)) 不加 不加 2 號(hào)管,3 號(hào)樣到 3
號(hào)管…)
補(bǔ)水到 20 μL 20 μL 20 μL
注:僅 ABI7500、7700 和 7900 儀器需要使用ROX 作為對(duì)照,其他熒光 PCR 儀器(如 iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene 3000、RotorGene 6000 和 LightCycler480)不需要使用 ROX。
11.蓋上蓋子后上機(jī),按下面參數(shù)進(jìn)行 PCR(具體 PCR 參數(shù)可以根據(jù)儀器不同而自行
優(yōu)化)。
過(guò)程 溫度 時(shí)間
預(yù)變性 95℃ 5 分鐘
PCR 反應(yīng)
(40 個(gè)循環(huán)) 95℃ 15 秒
60℃ 60 秒
12.數(shù)據(jù)采集
具體操作按所用儀器推薦的流程進(jìn)行。本產(chǎn)品中所含的熒光染料在不結(jié)合 DNA 時(shí), 大吸收光譜在 471 nm,結(jié)合 DNA 時(shí)的大吸收光譜在 500 nm,大發(fā)射光譜在 530 nm。
四、數(shù)據(jù)處理
13.以陽(yáng)性對(duì)照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測(cè)樣品
濃度的 log 和標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算出樣品 DNA 的濃度。
產(chǎn)品保存 低溫運(yùn)輸,-20℃保存
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