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整個(gè)過程大致如下:
1. 創(chuàng)建miRNA模擬物。
2. 將這些miRNA模擬物和pMirTrap載體共轉(zhuǎn)染到哺乳動(dòng)物細(xì)胞,并孵育24小時(shí)。同時(shí)利用miR-132、pMirTrap載體和pMirTrap對(duì)照載體開展對(duì)照轉(zhuǎn)染。
3. 利用附帶的MirTrap分離試劑盒裂解轉(zhuǎn)染后的細(xì)胞培養(yǎng)物。
4. 利用分離試劑盒中的磁珠對(duì)RISC復(fù)合物(其中包括靶標(biāo)mRNA)進(jìn)行免疫沉淀。
5. 利用附帶的NucleoSpin RNA XS試劑盒分離與磁珠結(jié)合的靶標(biāo)mRNA。
6. 通過qPCR或新一代測序分析分離出的RNA,鑒定出特定miRNA的靶標(biāo)mRNA。
MirTrap系統(tǒng)中包含了pMirTrap載體、免疫沉淀及后續(xù)分離所需的試劑、Xfect microRNA轉(zhuǎn)染試劑以及對(duì)照試劑,足夠15次分析使用。
Xfect microRNA轉(zhuǎn)染試劑也是Clontech推出的產(chǎn)品。它形成可生物降解的納米顆粒,從而實(shí)現(xiàn)miRNA的轉(zhuǎn)染。此試劑盒提供兩種轉(zhuǎn)染聚合物:Xfect MicroRNA Transfection Polymer,這是為小RNA的轉(zhuǎn)染而優(yōu)化的;Xfect Polymer,這是為質(zhì)粒DNA而優(yōu)化的。
在miRNA轉(zhuǎn)染時(shí),只需要Xfect MicroRNA Transfection Polymer;而在miRNA與質(zhì)粒DNA的共轉(zhuǎn)染時(shí),須在轉(zhuǎn)染反應(yīng)中加入少量的Xfect Polymer。
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