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1、 樣品失真或不見。

例如：H2O氣使氯硅樣品水解。

2、 色譜柱失效。

如H2O，CO2使分子篩柱失掉活性，H2O氣使聚脂類固定液分化，O2使PEG固定液斷鏈等。

3、 有時某些氣體雜質(zhì)和固定液相互作用而發(fā)生假峰。

4 、對色譜柱保存特性的影響。

如H2O對聚乙二醇等親水性固定液的保存指數(shù)會有所增加，載氣中氧含量過高時，無論是極性或?qū)﹀e極性固定液柱的保存特性，都會發(fā)生改變，運(yùn)用時刻越長影響越大；

5、 對檢測器的影響。

例如熱導(dǎo)檢測器（TCD）信噪比減小，無法調(diào)零，線性變窄，文獻(xiàn)中的校對因子不能運(yùn)用，氧含量過大，使元件在高溫時加快老化，削減壽數(shù)?；鹧骐x子化檢測器（FID）在Dt≤1×10-11/S下操作時，CH4等有機(jī)雜質(zhì)會使基流激增，噪聲加大不能進(jìn)行微量分析。

6、對測試結(jié)果影響。

例如在做程序升溫操作時，載氣中的某些雜質(zhì)，在低溫時保存在色譜柱中，當(dāng)柱溫升高時不光致使基線漂移，還能夠在譜圖上呈現(xiàn)比較寬的“假峰”。

7、對儀器的影響。

導(dǎo)致各類過濾器加快失效，調(diào)理閥被污染，氣阻阻塞，調(diào)理精度下降或失靈；氣路體系被污染，儀器靈敏度恢復(fù)成本高，污染嚴(yán)重時靈敏度將無法恢復(fù)。低純度氣體攜帶的水蒸汽會嚴(yán)重影響分析結(jié)果，甚至影響檢測器的壽命。