Illumina Miseq二代基因測序儀
是一臺在單個儀器上整合了擴增、測序和數(shù)據(jù)分析的新一代測序儀，每次運行能產(chǎn)生超過1 Gb的數(shù)據(jù)，且占地面積僅為2平方英尺。MiSeq有著革命性的流程和*的準(zhǔn)確性，這讓它成為快速且經(jīng)濟高效的遺傳分析的理想平臺，適合廣泛的應(yīng)用。
Illumina Miseq二代基因測序儀
技術(shù)特性：
·現(xiàn)有NGS平臺中短的實驗周期：從樣品制備開始只需要8小時即可得到超過100M的高質(zhì)量測序結(jié)果。
·現(xiàn)有NGS平臺中較便捷的樣品制備流程：只需50ngDNA模板，2小時的自動化操作就可以完成全部樣品制備工作。
·現(xiàn)在NGS平臺中較精確的測序原理：MiSeq繼續(xù)GA和HiSeq平臺的邊合成邊測序的化學(xué)原理，數(shù)千篇高質(zhì)量的期刊文章是對Illumina NGS平臺測序結(jié)果可信度較有力的證明。
·現(xiàn)在NGS平臺中完整的整合功能：MiSeq可以獨立完成簇生成，雙向測序及數(shù)據(jù)分析工作，讓經(jīng)費和實驗室空間不再成為NGS研究的障礙。
短的時間內(nèi)獲得答案，智能化的工作流程，廣泛的測序應(yīng)用范圍
Illumina公司推出的MiSeq是一臺在單個儀器上整合了擴增、測序和數(shù)據(jù)分析的新一代測序儀，每次運行能產(chǎn)生超過1 Gb的數(shù)據(jù)，且占地面積僅為2平方英尺。MiSeq有著革命性的流程和*的準(zhǔn)確性，這讓它成為快速且經(jīng)濟高效的遺傳分析的理想平臺，適合廣泛的應(yīng)用。同時根據(jù)Illumina的消息，今年9月份左右，MiSeq系統(tǒng)的測序通量將會升級至7G左右。升級將通過兩個方面完成，一個是cluster密度的增大，升級后cluster密度將會增加至12-15million，而pair-end讀取的reads數(shù)目將會增加至24-30million；另一方面是通過測序讀長而提升通量，屆時測序讀長會達到2*250bp，同時測序速度也會有所提升。目前，Broad研究院已經(jīng)利用現(xiàn)有試劑實現(xiàn)了單端測序300bp讀長，Illumina目前內(nèi)部測序更是完成了2*400bp的pair-end測序。而這些，都是保證在高質(zhì)量數(shù)據(jù)結(jié)果的前提下完成的。
MiSeq性能參數(shù)
讀長 | 測序時間 | 數(shù)據(jù)量 | 數(shù)據(jù)質(zhì)量 |
1×35bp | 4小時 | >120 M | >90%數(shù)據(jù)高于Q30 |
2×100bp | 19小時 | >680 M | >80%數(shù)據(jù)高于Q30 |
2×150bp | 27小時 | >1 GB | >75%數(shù)據(jù)高于Q30 |
Illumina Miseq二代基因測序儀
四大特性
1、短的實驗周期：從樣品制備開始只需要8小時即可得到超過100M的高質(zhì)量測序結(jié)果。
2、較便捷的樣品制備流程：只需50ngDNA模板，2小時的自動化操作就可以完成全部樣品制備工作。
3、較精確的測序原理：MiSeq繼續(xù)GA和HiSeq平臺的邊合成邊測序的化學(xué)原理，數(shù)千篇高質(zhì)量的期刊文章是對Illumina NGS平臺測序結(jié)果可信度較有力的證明。
4、完整的整合功能：MiSeq可以獨立完成簇生成，雙向測序及數(shù)據(jù)分析工作，讓經(jīng)費和實驗室空間不再成為NGS研究的障礙。
應(yīng)用范圍
1、轉(zhuǎn)錄組測序
派森諾MiSeq測序平臺是基因組已測序物種的轉(zhuǎn)錄組分析平臺。公司技術(shù)團隊目前已完成了包括斑馬魚在內(nèi)的多種植物、動物的轉(zhuǎn)錄組測序及分析。
2、宏基因組16S rDNA單V區(qū)測序
對16s rDNA的單V區(qū)(V3V4)進行高通量測序，鑒定細菌群和古生菌群。派森諾的技術(shù)團隊使用Illumina MiSeq測序16S rDNA V4區(qū)并結(jié)合Roche 454 FLX+測序16S rDNA V1~V3區(qū)成功的對雞的腸道環(huán)境細菌進行了鑒定。
3、Small RNA測序
1*35bp的讀長*地配合了小RNA的測序長度，速度快，靈敏度高。派森諾的技術(shù)團隊目前已完成了鵝的小RNA測序和多種中草藥的小RNA測序。
4、重測序：
包括全基因組重測序、簡化基因組測序、外顯子測序。
Illumina MiSeq非常適用于對微生物基因組的重測序，每次運行即可完成一個微生物基因組測序。2011年12月27日，派森諾的技術(shù)團隊利用MiSeq一次運行同時完成了乳酸菌
（Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8）的重測序，基因組覆蓋深度為分別為404倍和213倍，比對至參考序列，基因組覆蓋率為，同時檢測到了多種結(jié)構(gòu)變異，包括插入、缺失和SNP位點，并且檢測到了全部質(zhì)粒。
