Illumina Miseq二代基因測(cè)序儀
是一臺(tái)在單個(gè)儀器上整合了擴(kuò)增、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析的新一代測(cè)序儀，每次運(yùn)行能產(chǎn)生超過(guò)1 Gb的數(shù)據(jù)，且占地面積僅為2平方英尺。MiSeq有著革命性的流程和*的準(zhǔn)確性，這讓它成為快速且經(jīng)濟(jì)高效的遺傳分析的理想平臺(tái)，適合廣泛的應(yīng)用。
Illumina Miseq二代基因測(cè)序儀
技術(shù)特性：
·現(xiàn)有NGS平臺(tái)中短的實(shí)驗(yàn)周期：從樣品制備開(kāi)始只需要8小時(shí)即可得到超過(guò)100M的高質(zhì)量測(cè)序結(jié)果。
·現(xiàn)有NGS平臺(tái)中較便捷的樣品制備流程：只需50ngDNA模板，2小時(shí)的自動(dòng)化操作就可以完成全部樣品制備工作。
·現(xiàn)在NGS平臺(tái)中較精確的測(cè)序原理：MiSeq繼續(xù)GA和HiSeq平臺(tái)的邊合成邊測(cè)序的化學(xué)原理，數(shù)千篇高質(zhì)量的期刊文章是對(duì)Illumina NGS平臺(tái)測(cè)序結(jié)果可信度較有力的證明。
·現(xiàn)在NGS平臺(tái)中完整的整合功能：MiSeq可以獨(dú)立完成簇生成，雙向測(cè)序及數(shù)據(jù)分析工作，讓經(jīng)費(fèi)和實(shí)驗(yàn)室空間不再成為NGS研究的障礙。
短的時(shí)間內(nèi)獲得答案，智能化的工作流程，廣泛的測(cè)序應(yīng)用范圍
Illumina公司推出的MiSeq是一臺(tái)在單個(gè)儀器上整合了擴(kuò)增、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析的新一代測(cè)序儀，每次運(yùn)行能產(chǎn)生超過(guò)1 Gb的數(shù)據(jù)，且占地面積僅為2平方英尺。MiSeq有著革命性的流程和*的準(zhǔn)確性，這讓它成為快速且經(jīng)濟(jì)高效的遺傳分析的理想平臺(tái)，適合廣泛的應(yīng)用。同時(shí)根據(jù)Illumina的消息，今年9月份左右，MiSeq系統(tǒng)的測(cè)序通量將會(huì)升級(jí)至7G左右。升級(jí)將通過(guò)兩個(gè)方面完成，一個(gè)是cluster密度的增大，升級(jí)后cluster密度將會(huì)增加至12-15million，而pair-end讀取的reads數(shù)目將會(huì)增加至24-30million；另一方面是通過(guò)測(cè)序讀長(zhǎng)而提升通量，屆時(shí)測(cè)序讀長(zhǎng)會(huì)達(dá)到2*250bp，同時(shí)測(cè)序速度也會(huì)有所提升。目前，Broad研究院已經(jīng)利用現(xiàn)有試劑實(shí)現(xiàn)了單端測(cè)序300bp讀長(zhǎng)，Illumina目前內(nèi)部測(cè)序更是完成了2*400bp的pair-end測(cè)序。而這些，都是保證在高質(zhì)量數(shù)據(jù)結(jié)果的前提下完成的。
MiSeq性能參數(shù)
讀長(zhǎng) | 測(cè)序時(shí)間 | 數(shù)據(jù)量 | 數(shù)據(jù)質(zhì)量 |
1×35bp | 4小時(shí) | >120 M | >90%數(shù)據(jù)高于Q30 |
2×100bp | 19小時(shí) | >680 M | >80%數(shù)據(jù)高于Q30 |
2×150bp | 27小時(shí) | >1 GB | >75%數(shù)據(jù)高于Q30 |
Illumina Miseq二代基因測(cè)序儀
四大特性
1、短的實(shí)驗(yàn)周期：從樣品制備開(kāi)始只需要8小時(shí)即可得到超過(guò)100M的高質(zhì)量測(cè)序結(jié)果。
2、較便捷的樣品制備流程：只需50ngDNA模板，2小時(shí)的自動(dòng)化操作就可以完成全部樣品制備工作。
3、較精確的測(cè)序原理：MiSeq繼續(xù)GA和HiSeq平臺(tái)的邊合成邊測(cè)序的化學(xué)原理，數(shù)千篇高質(zhì)量的期刊文章是對(duì)Illumina NGS平臺(tái)測(cè)序結(jié)果可信度較有力的證明。
4、完整的整合功能：MiSeq可以獨(dú)立完成簇生成，雙向測(cè)序及數(shù)據(jù)分析工作，讓經(jīng)費(fèi)和實(shí)驗(yàn)室空間不再成為NGS研究的障礙。
應(yīng)用范圍
1、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
派森諾MiSeq測(cè)序平臺(tái)是基因組已測(cè)序物種的轉(zhuǎn)錄組分析平臺(tái)。公司技術(shù)團(tuán)隊(duì)目前已完成了包括斑馬魚(yú)在內(nèi)的多種植物、動(dòng)物的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及分析。
2、宏基因組16S rDNA單V區(qū)測(cè)序
對(duì)16s rDNA的單V區(qū)(V3V4)進(jìn)行高通量測(cè)序，鑒定細(xì)菌群和古生菌群。派森諾的技術(shù)團(tuán)隊(duì)使用Illumina MiSeq測(cè)序16S rDNA V4區(qū)并結(jié)合Roche 454 FLX+測(cè)序16S rDNA V1~V3區(qū)成功的對(duì)雞的腸道環(huán)境細(xì)菌進(jìn)行了鑒定。
3、Small RNA測(cè)序
1*35bp的讀長(zhǎng)*地配合了小RNA的測(cè)序長(zhǎng)度，速度快，靈敏度高。派森諾的技術(shù)團(tuán)隊(duì)目前已完成了鵝的小RNA測(cè)序和多種中草藥的小RNA測(cè)序。
4、重測(cè)序：
包括全基因組重測(cè)序、簡(jiǎn)化基因組測(cè)序、外顯子測(cè)序。
Illumina MiSeq非常適用于對(duì)微生物基因組的重測(cè)序，每次運(yùn)行即可完成一個(gè)微生物基因組測(cè)序。2011年12月27日，派森諾的技術(shù)團(tuán)隊(duì)利用MiSeq一次運(yùn)行同時(shí)完成了乳酸菌
（Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8）的重測(cè)序，基因組覆蓋深度為分別為404倍和213倍，比對(duì)至參考序列，基因組覆蓋率為，同時(shí)檢測(cè)到了多種結(jié)構(gòu)變異，包括插入、缺失和SNP位點(diǎn)，并且檢測(cè)到了全部質(zhì)粒。
