模式生物:酵母菌的特性!
模式生物:酵母菌的特性!
菌種保藏酵母作為高等真核生物特別是人類基因組研究的模式生物,其直接的作用體現(xiàn)在生物信息學(xué)領(lǐng)域。當(dāng)人們發(fā)現(xiàn)了一個功能未知的人類新基因時,可以迅速地到任何一個酵母基因組數(shù)據(jù)庫中檢索與之同源的功能已知的酵母基因,并獲得其功能方面的相關(guān)信息,從而加快對該人類基因的功能研究。
研究發(fā)現(xiàn),有許多涉及遺傳性疾病的基因均與酵母基因具有很高的同源性,研究這些基因編碼的蛋白質(zhì)的生理功能以及它們與其它蛋白質(zhì)之間的相互作用將有助于加深對這些遺傳性疾病的了解。
此外,人類許多重要的疾病,如早期糖尿病、小腸癌和心臟疾病,均是多基因遺傳性疾病,揭示涉及這些疾病的所有相關(guān)基因是一個困難而漫長的過程,酵母基因與人類多基因遺傳性疾病相關(guān)基因之間的相似性將為我們提高診斷和治療水平提供重要的幫助。
酵母作為模式生物的例子體現(xiàn)在那些通過連鎖分析、定位克隆然后測序驗證而獲得的人類遺傳性疾病相關(guān)基因的研究中,后者的核苷酸序列與酵母基因的同源性為其功能研究提供了的線索。
例如,人類遺傳性非息肉性小腸癌相關(guān)基因與酵母的MLH1、MSH2基因,運動失調(diào)性毛細血管擴張癥相關(guān)基因與酵母的TEL1基因,布盧姆氏綜合征相關(guān)基因與酵母的SGS1基因,都有很高的同源性(見表2)。遺傳性非息肉性小腸癌基因在腫瘤細胞中表現(xiàn)出核苷酸短重復(fù)順序不穩(wěn)定的細胞表型,而在該人類基因被克隆以前,研究工作者在酵母中分離到具有相同表型的基因突變(msh2和mlh1突變)。受這個結(jié)果啟發(fā),人們推測小腸癌基因是MSH2和MLH1的同源基因,而它們在核苷酸序列上的同源性則進一步證實了這一推測。
布盧姆氏綜合征是一種臨床表現(xiàn)為性早熟的遺傳性疾病,病人的細胞在體外培養(yǎng)時表現(xiàn)出生命周期縮短的表型,而其相關(guān)基因則與酵母中編碼蝸牛酶的SGS1基因具有很高的同源性。與來自布盧姆氏綜合征個體的培養(yǎng)細胞相似,SGS1基因突變的酵母細胞表現(xiàn)出顯著縮短的生命周期。Francoise等研究了170多個通過功能克隆得到的人類基因,發(fā)現(xiàn)它們中有42%與酵母基因具有明顯的同源性,這些人類基因的編碼產(chǎn)物大部分與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑、膜運輸或者DNA合成與修復(fù)有關(guān),而那些與酵母基因沒有明顯同源性的人類基因主要編碼一些膜受體、血液或免疫系統(tǒng)組分,或人類特殊代謝途徑中某些重要的酶和蛋白質(zhì)。
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