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PCR檢測(cè)試劑盒使用說(shuō)明
1:樣品準(zhǔn)備:取1毫升細(xì)胞培養(yǎng)上清(貼壁和懸浮細(xì)胞都可以,已培養(yǎng)48小時(shí)以上),在16000g離心5分鐘,小心棄去上清,避免丟失沉淀(沉淀量有可能很少,目視看不到)。將沉淀用無(wú)菌PBS重懸,在16000g離心5分鐘,同樣小心棄去上清,如此反復(fù)用無(wú)菌PBS洗三次。后將獲得的沉淀用100微升超純水重懸,置于100℃水浴中孵育5分鐘。如此制備好的樣品可在4℃保存1到2個(gè)月。
2:PCR反應(yīng)的準(zhǔn)備:
待各組份融化后先瞬時(shí)離心,然后輕彈混勻。按下表在已滅菌的PCR管中配制反應(yīng)體系,每次實(shí)驗(yàn)需加一個(gè)陰性和一個(gè)陽(yáng)性對(duì)照,測(cè)試反應(yīng)管可以有多個(gè)。配制過(guò)程中應(yīng)注意無(wú)菌,并注意避免操作產(chǎn)生的氣溶膠造成樣品間的交叉污染,推薦在有風(fēng)壓的設(shè)備如超凈臺(tái)或生物安全柜中進(jìn)行操作。建議配制完畢后瞬時(shí)離心以使液體沉至管底。
3:PCR反應(yīng):
降落PCR法(Touchdown PCR):94℃變性2分鐘;首循環(huán):94℃變性30秒,68℃退火30秒,72℃延伸45秒;從第二到八個(gè)循環(huán)開(kāi)始,每循環(huán)退火溫度下降1℃,其余不變;從第九個(gè)循環(huán)開(kāi)始,反應(yīng)條件固定為:94℃變性30秒,60℃退火30秒,72℃延伸45秒,循環(huán)32次;循環(huán)結(jié)束后,在72℃延伸7分鐘,后保持在4℃。
4:瓊脂糖凝膠電泳:
按常規(guī)方法準(zhǔn)備好2%瓊脂糖凝膠,加入EB或Gold-View等用于顯色。每份反應(yīng)液取8微升,無(wú)須加入上樣緩沖液,直接加入凝膠加樣孔中,另留一孔加入DNA marker(要求在400-700bp區(qū)間有顯示條帶),120伏電泳約30分鐘。在紫外線下觀察電泳結(jié)果,陽(yáng)性對(duì)照應(yīng)在643bp處有一條帶,陰性對(duì)照無(wú)條帶,檢測(cè)條帶在438-470bp區(qū)間。
PCR檢測(cè)試劑盒注意事項(xiàng)
1:組份A中含有染料,染料的加入不影響PCR反應(yīng),反應(yīng)產(chǎn)物可直接電泳,節(jié)省時(shí)間。
2:本試劑盒檢測(cè)范圍涵蓋支原體所有種屬,真核細(xì)胞和革蘭氏陰性菌不會(huì)造成干擾,與支原體親緣關(guān)系較近的革蘭氏陽(yáng)性菌在反應(yīng)中的靈敏度較支原體低1000-10000倍。
3:本試劑盒適用于檢測(cè)支原體感染,客戶如需區(qū)分感染的種屬,可將PCR產(chǎn)物切膠然后測(cè)序,進(jìn)行序列比對(duì)即可知種屬類型。
4:有時(shí)可直接用細(xì)胞培養(yǎng)上清進(jìn)行PCR反應(yīng)。培養(yǎng)上清中常含有高濃度的PCR抑制劑,可能導(dǎo)致假陰性結(jié)果,故不建議使用此法。有些PCR抑制劑用離心可以除去,若離心不能去除,則推薦抽提基因組DNA進(jìn)行PCR。而某些PCR抑制劑,如黑色素,通過(guò)抽提基因組DNA也不能去除,此時(shí)可以通過(guò)加入高濃度(如2%)的BSA(牛血清白蛋白)中和其抑制活性。
5:假陰性結(jié)果判斷方法:在測(cè)試反應(yīng)管中同時(shí)加入測(cè)試樣品和陽(yáng)性對(duì)照樣品,觀察對(duì)照條帶是否出現(xiàn)。在陽(yáng)性對(duì)照管出現(xiàn)對(duì)照條帶的情況下,如果測(cè)試反應(yīng)管的對(duì)照條帶和檢測(cè)條帶都沒(méi)有出現(xiàn),則可判斷為PCR反應(yīng)受到了抑制,即假陰性結(jié)果。陽(yáng)性對(duì)照管如果沒(méi)有出現(xiàn)對(duì)照條帶,請(qǐng)檢查PCR條件是否恰當(dāng),或者與技術(shù)支持聯(lián)系。
6:每個(gè)測(cè)試樣品建議做兩個(gè)反應(yīng):一個(gè)與陽(yáng)性對(duì)照樣品共同反應(yīng),排除假陰性結(jié)果,另一個(gè)單獨(dú)反應(yīng),可避免因加入陽(yáng)性對(duì)照樣品所致的靈敏度降低。如果測(cè)試樣品中支原體含量很高,可能會(huì)抑制陽(yáng)性對(duì)照條帶的出現(xiàn)。
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