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宏基因組測序服務(微生物多樣性研究)
微生物群體幾乎存在于世界的每一個生態(tài)群落之中,且扮演著重要的的角色。傳統(tǒng)的微生物培養(yǎng)及鑒定方法,極大地限制了微生物多樣性資源的研究及開發(fā)利用。宏基因組測序,能夠快速準確的得到大量生物數(shù)據(jù)和豐富的微生物信息,是研究微生物多樣性和群落特征的重要手段。
技術原理
2005 年,加州大學伯克利分校的 Kevin Chen 和Lior Pachter 將宏基因組定文為“應用現(xiàn)代基因組學的技木直接研究自然狀態(tài)下的微生物的有機群落,而不需要在實驗室中分離單一的菌株”的科學。宏基因組測序是以特定生境中的整個微生物群落作為研究對象,提取環(huán)境樣本總 DNA,獲得環(huán)境微生物基因信息總和,研究環(huán)境微生物的群落結構、物種分類、基因功能及代謝網絡等,具有通量高、速度快、信息全等特點,在鑒定低豐度的微生物群落、挖掘更多基因資源方面具有很大優(yōu)勢。
樣本類型
土壤、水體、污泥、腸道物、糞便、皮膚、食品發(fā)酵液等。
技術路線
樣品準備
DNA提取
DNA檢測
文庫制備
文庫質檢
上機測序
生信分析
技術優(yōu)點
應用廣
通量高
速度快
數(shù)據(jù)全(不僅可以鑒定微生物群落,還可以挖掘功能基因及其代謝途徑)
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