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在發(fā)表的細(xì)胞株新研究論文中,Schreiber和Broad研究所的同事對(duì)這一門戶進(jìn)行了描述,指出其中包含的信息是通過(guò)測(cè)量240種癌細(xì)胞系對(duì)于超過(guò)350種靶向細(xì)胞回路不同節(jié)點(diǎn)的化合物的反應(yīng)而獲得。這些細(xì)胞系來(lái)自許多不同種類的腫瘤,另一項(xiàng)稱作為癌細(xì)胞系百科全書(Cancer Cell Line Encyclopedia,CCLE)的互補(bǔ)研究已經(jīng)確定了這些細(xì)胞系的基因組特征。在美國(guó)國(guó)家癌癥研究所癌癥靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)和開發(fā)(CTD2)項(xiàng)目的支持下,CTRP充分利用了CCLE的公共數(shù)據(jù),其中包含了有關(guān)每個(gè)癌細(xì)胞系突變、基因表達(dá)和其他基因組改變的信息。
Schreiber說(shuō):“CTRP和CCLE兩個(gè)項(xiàng)目顯著不同但又*地互補(bǔ)。兩者都是處于早期發(fā)展階段。隨著每個(gè)資源中數(shù)據(jù)的數(shù)量和多樣性不斷地增長(zhǎng),我們預(yù)計(jì)匹配患者與潛在有效藥物的能力將會(huì)大大地提高。”
Schreiber和同事們證明,研究中的這組化合物可以用來(lái)發(fā)現(xiàn)癌細(xì)胞系從前未檢測(cè)到的依賴性。隨著正常細(xì)胞一步步地變?yōu)榘┘?xì)胞,它會(huì)累積大量的促癌遺傳改變,使得細(xì)胞能夠不受控制地分裂和存活。此外,在癌癥形成的過(guò)程中,其他通常在細(xì)胞中發(fā)揮無(wú)害作用的基因有可能變得對(duì)癌癥生存至關(guān)重要。通過(guò)讓細(xì)胞系暴露于不同的化合物中,研究人員能夠揭示癌細(xì)胞生存所必需的蛋白質(zhì),并有可能提供新的治療靶點(diǎn)。
Schreiber.說(shuō):“這些基因或許在癌癥早期階段沒有發(fā)揮內(nèi)在作用,但隨著癌細(xì)胞形成,它會(huì)收編一些正常的蛋白質(zhì)成為癌基因的伙伴。這就是我們真正想要揭露的:基因自身沒有被癌癥所改變,但卻與癌基因結(jié)合到了一起。這一門戶是揭示這些依賴性的一種好的途徑。”
在他們的論文中,Schreiber和同事們描述了一個(gè)如何利用CTRP來(lái)發(fā)現(xiàn)候選依賴性的例子。研究小組發(fā)現(xiàn)一種在細(xì)胞株肺癌臨床試驗(yàn)中測(cè)試的藥物navitoclax,或許能夠尤其有效地靶向帶有CTNNB1突變的癌細(xì)胞系。CTNNB1突變存在于一些大腸癌、肝細(xì)胞癌、胃癌和子宮內(nèi)膜癌中。這只是一個(gè)關(guān)于CTRP如何能夠幫助揭示有用生物標(biāo)記物的例子,利用生物標(biāo)記物可以預(yù)測(cè)藥物反應(yīng)和耐藥。除了發(fā)現(xiàn)已開發(fā)藥物的新用途,CTRP還可用于鑒別新的治療靶點(diǎn)。
雷尼替丁相關(guān)物質(zhì)A標(biāo)準(zhǔn)品 91224-69-0 50mg
雷尼替丁相關(guān)物質(zhì)B標(biāo)準(zhǔn)品 72126-78-4 50mg
雷尼替丁相關(guān)物質(zhì)C標(biāo)準(zhǔn)品 73851-70-4 50mg
類姜黃素標(biāo)準(zhǔn)品 300mg Curcuminoids
利巴韋林標(biāo)準(zhǔn)品 36791-04-5 200mg Ribavirin
利多卡因標(biāo)準(zhǔn)品 137-58-6 250mg Lidocaine
利福布丁標(biāo)準(zhǔn)品 72559-06-9 50mg Rifabutin
利福平標(biāo)準(zhǔn)品 13292-46-1 300mg Rifampin
利福平醌標(biāo)準(zhǔn)品 13983-13-6 25mg Rifampin Quinone
利魯唑標(biāo)準(zhǔn)品 1744-22-5 200mg Riluzole
利魯唑相關(guān)物質(zhì)A標(biāo)準(zhǔn)品 461-82-5 25mg Riluzole Related Compound A
利奈孕醇標(biāo)準(zhǔn)品 52-76-6 20mg Lynestrenol
利尿酸標(biāo)準(zhǔn)品 58-54-8 200mg Ethacrynic Acid
細(xì)胞株
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